En 2025, la souveraineté numérique en e-santé est bien plus qu’un sujet de compliance. Elle est devenue un enjeu stratégique pour la pérennité, la compétitivité et la confiance dans les systèmes de soin numériques.
Face aux risques juridiques, aux exigences du RGPD, aux contraintes HDS et aux ambitions européennes (ex : GAIA-X, Espace Européen des Données de Santé), les structures doivent reprendre le contrôle de leurs outils numériques.

👉 Dans cet article, je partage une sélection d’outils européens, gratuits et open source, testés ou validés, qui permettent de concilier performance, conformité et souveraineté.
🔐 1. Pourquoi la souveraineté numérique est devenue une priorité stratégique en santé
- Le RGPD ne suffit plus : il faut une maîtrise totale de la chaîne technique.
- Les lois extraterritoriales type Cloud Act exposent les données sensibles.
- Les acteurs publics (CNIL, ANSSI, UE) renforcent leurs exigences.
✉️ 2. Messagerie & Communication Sécurisées
- Proton Mail 🇨🇭 : Chiffrement de bout en bout, hébergement en Suisse, interface pro.
- Mailo 🇫🇷 : Alternative RGPD française avec des options pro et un webmail fluide.
- Tutanota Companies 🇩🇪 : Chiffrement natif, interface épurée, idéal pour une utilisation quotidienne.
📁 3. Stockage et partage de fichiers médicaux
- Nextcloud 🇩🇪 : Plateforme complète, hébergement local, contrôle d’accès avancé.
- Seafile Ltd 🇩🇪 : Performant pour les gros volumes, synchronisation rapide.
- CryptoPad – Digital Asset Manager 🇫🇷 : Collaboratif, idéal pour comités de pilotage – à confirmer.
🎥 4. Collaboration & visioconférence
- Jitsi Meet : Simple, efficace, sans compte nécessaire.
- Rocket.Chat : Slack-like souverain, avec intégration LDAP et déploiement privé.
- The Zulip Open Source Project : Messagerie d’équipe puissante et flexible, auto hébergée.
📊 5. Gestion de projets open source
- Tuleap 🇫🇷 : Plateforme collaborative complète (gestion de projet, suivi des exigences, gestion des tests, etc.), conçue pour la collaboration et la conformité.
- OpenProject | open source project management software 🇪🇺 : Vue Gantt + Kanban, idéal pour les projets multidisciplinaires.
- Redmine Networks : Ultra flexible, compatible avec les SI complexes.
- Taiga 🇪🇸 : Léger, intuitif, parfait pour start-up et phases d’idéation.
🧾 6. ERP/CRM pour la gestion administrative
- Dolibarr ERP CRM (official) 🇫🇷 : Pensé pour les PME françaises, très accessible.
- ERPNext : Alternative tech-friendly, à personnaliser selon les besoins santé.
📈 7. Analyse et dataviz confidentielles
- Metabase : Tableaux de bord connectés, auto hébergement simple.
- KNIME 🇩🇪 : Solution visuelle pour data scientists et chercheurs.
🧠 Conclusion
S’équiper avec des outils souverains n’est plus un frein à l’innovation. C’est un levier stratégique de confiance, de conformité et de résilience.
🧭 Chez JuliaShift, nous accompagnons les start-up, établissements et éditeurs de santé dans le choix, l’intégration et la structuration d’outils numériques souverains et performants.
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Nicolas Schneider
https://juliashift.euFondateur de JuliaShift, spécialisé en transformation numérique en santé.